《黑暗地带：第51区》将是以著名的未被证实的美国第51区为故事主线，51区是一个传说中从来未被公开的美国一个地区，独立于美国其他50区，是一个以外星研究和一些极度机密工作为主的地区。游戏的主题就是和外星人，异形之间的战斗。当51区遭受外星人袭击之后，美国政府派出了一直秘密部队，玩家就要扮演其中的一名战士，这支部队拥有很高的自主权，可以自由决定战场上的一切活动，不受政府法律的限制，当然也可以使用许多还在测试中的高科技武器，玩家需要做的就是在尽量生存下来，消灭尽量多的外星生物。